แม้ว่าสัตว์น้ำจะมีประโยชน์หลายด้าน แต่ก็มีข้อกังวลหลายประการเกี่ยวกับการใช้งาน ในหลายกรณีปัญหาได้เกิดขึ้นแล้วและได้รับการแก้ไข
อย่างไรก็ตามการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำอาจก่อให้เกิดปัญหาและความกังวลที่ต้องแก้ไขโดยเฉพาะอย่างยิ่งหากมีการพิจารณาให้มีส่วนร่วมในอุตสาหกรรม
ปัญหาต่างๆที่เพาะเลี้ยงสัตว์เลี้ยง
ต่อไปนี้เป็นปัญหาทั่วไปที่เกี่ยวข้องกับการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ 5 ประการ
สิ่งแวดล้อม: เช่นเดียวกับพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำขนาดใหญ่ฟาร์มเลี้ยงปลาที่ใช้ที่ดินอยู่ในถังบรรจุน้ำสกปรกที่ต้องเปลี่ยน ขึ้นอยู่กับการติดตั้งระบบนี้อาจส่งผลให้มีการปล่อยน้ำเสียที่มีอยู่จำนวนมากซึ่งประกอบด้วยอุจจาระสารอาหารและสารเคมีที่ปล่อยออกสู่สิ่งแวดล้อม การปลดปล่อยสารนี้อาจส่งผลให้สาหร่ายบุปผาซึ่งในที่สุดจะเอาออกซิเจนที่ละลายในท่อระบายน้ำที่ได้รับหรือ eutrophication ปริมาณออกซิเจนที่เป็นศูนย์ส่งผลให้ฆ่าปลาตาย
นอกจากนี้สารเคมีเช่นยาปฏิชีวนะและสารบำบัดน้ำมักใช้ในอุตสาหกรรมเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำและระบบเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจำเป็นต้องปิดสนิทหรือบำบัดน้ำเสียก่อนปล่อย
โรค: การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำสามารถแพร่เชื้อปรสิตและโรคลงไปในป่า เช่นเดียวกับหีบห่อไก่ในเชิงพาณิชย์จะต้องสะอาดและเป็นที่รู้จักสำหรับการแพร่กระจายของโรคปลาที่เลี้ยงและหอยอาจอยู่ในสถานการณ์เดียวกัน
ปลาที่เลี้ยงในฟาร์มมีโอกาสเพิ่มขึ้นในการรับปรสิตเช่นเหาทะยางค์เมื่อเทียบกับปลาที่อาศัยและผสมพันธุ์ในสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติปลาที่เลี้ยงในฟาร์มยังต้องเผชิญกับโรคโดยการใช้ปลาที่ยังไม่ได้ใช้เป็นแหล่งอาหารในทางตรงกันข้ามกับปลาจากกระบวนการผลิตที่ปลอดภัยกว่า
การหลบหนี:
การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำเป็นหนึ่งในสาเหตุที่ใหญ่ที่สุดของการเกิดสิ่งแปลกปลอมเข้าสู่พื้นที่ใหม่ซึ่งก่อให้เกิดชนิดที่รุกรานภายใต้สภาวะที่เหมาะสม ปลาที่เลี้ยงในฟาร์มสามารถหลบหนีจากปากกาได้ทำลายสิ่งแวดล้อมและคุกคามประชากรปลาพื้นเมือง
ผลที่ตามมาคือปลาที่หนีออกมาจากฟาร์มสามารถแข่งขันเพื่อหาอาหารและที่อยู่อาศัยแทนที่สัตว์พื้นเมืองและแทรกแซงชีวิตสัตว์ป่าได้ พวกเขายังสามารถนำโรคและปรสิตที่อาจฆ่าสายพันธุ์พื้นเมือง นอกจากนี้ปลาที่เลี้ยงปลาที่หนีได้สามารถผสมพันธุ์กับสต็อกป่าซึ่งสามารถเจือจางยีนของยีนและยับยั้งการอยู่รอดและวิวัฒนาการของพันธุ์ป่าได้ในระยะยาว
ผลกระทบรอง:
เนื่องจากปลาที่เลี้ยงต้องมีแหล่งอาหารสัตว์ป่าชนิดอื่น ๆ จึงเสี่ยงต่อการตกปลามากเกินไปในการผลิตอาหารปลา เนื่องจากปลาที่เลี้ยงในฟาร์มส่วนใหญ่เป็นสัตว์กินเนื้อเป็นอาหารกินปลาทั้งตัวหรือปลาที่ทำจากปลา ชนิดเช่นปลาทู, ปลาชนิดหนึ่งและปลาไวทิงถูกคุกคามเนื่องจากความจำเป็นในการสร้างอาหารสำหรับสายพันธุ์ที่เลี้ยง ผลกระทบต่อการก่อสร้าง:
ทั้งสัตว์บกและสัตว์น้ำสามารถสูญเสียแหล่งที่อยู่อาศัยได้โดยการสร้างสิ่งอำนวยความสะดวกด้านการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำตามแนวชายฝั่งซึ่งสามารถเข้าถึงน้ำที่สะอาดและเป็นธรรมชาติสำหรับกระบวนการของมัน ในตัวอย่างที่มีชื่อเสียงในเอเชียและลาตินอเมริกาป่าชายเลนได้รับการล้างเพื่อให้มีพื้นที่สำหรับฟาร์มเลี้ยงกุ้ง